Esta Entra va sobre un problema que he visto que pasa a mucha gente y por lo menos yo he solucionado de esta manera que no se si servirá para todo el mundo.

El problema que quiero solucionar es cuando tienes una partición que sea para window y otra para linux y quieras descargar con el emule(en ambas particiones). con el sistema operativo windows 7 y no se si con el windows vista también, pero modifica un poco la estructura de la partición. el emule al trabajar en los dos sistemas operativos el emule en linux cambia las propiedades del la partición a solo lectura, y no es cambiando el archivo de configuración de las particiones sino hay que hacer un formateo esta partición, pero sin perder por ello los datos. Porque como la partición que quieres formatear es del mismo tipo que hay en la actualidad pues cambia unos parámetros, hace que el emule no bloque esa partición.
El programita que consigue esta marabilla es «gparted«

Este es un programa muy sencillo de usar e instalar, puedes dar formato a las particiones de tu disco duro seleccionado una de ellas y diciendo los diferentes formatos.
La forma de instalarlo seria abriendo un terminal y poniendo este comando.

sudo apt-get install gparted

cuando se termine de instalar se encontrara en Sistema -> administración-> Gparted

si quieres formatear la partición en ntfs deberías hacerlo desde windows porque en linux solo se puede hacer la escritura y la lectura.